、菌种选择 小孔栽培菌种应选择出耳较早且齐、木耳黑厚呈碗状、开片好、耐高温高湿、不易烂耳的品种，如黑29、916、新科、单片木耳等。
二、菌袋选择 小孔出耳怕袋料分离，因为小孔栽培孔径较小，全光管理时袋料分离处的木耳容易被塑料挡住，长不出袋外。因此，要选用与菌丝亲合力好的塑料袋，袋料不易分离，可提高产量降低风险。
三、制菌方法 用颈圈、棉塞方法制作的菌袋，上部菌龄长易老化，袋料易分离，影响出耳。所以，小孔栽培一般采用免颈圈倒置法。免颈圈倒置法：装袋后，将菌袋中间打上孔，用木扦将料上面的塑料袋顶入孔中，然后用棉塞将孔堵严。蒸菌时将菌袋倒置放入筐中，出锅后待菌袋温度降到25℃以下，将菌种接到孔中。菌从中间向外生长，上下菌龄一致，而且蒸锅时倒置，使菌袋上下水分一致，这样养好的菌袋一般不会出现袋料分离现象。小孔出耳养菌时要立袋、单层或双层摆放，这样袋料不易分离。
四、孔数、孔径选择
1、孔径 现生产中一般用直径0.65cm的三棱形打孔器打孔。
2、孔数 规格16.5×35cm菌袋，每袋打孔数160－180个为宜，根据菌袋和孔径大小可灵活掌握打孔数量。
五、管理方法
1、催芽管理 与常规划口催芽管理一样。可采用室内、大棚或室外集中催芽。注意问题：室内催芽时，温度控制在20℃以下，防止烧菌；室外催芽时，注意保湿，尽量使耳芽出齐并长出袋外；如果袋料分离或因孔小耳芽长不出袋外时，可将塑料袋扒掉，全光管理，白天勤浇水保湿。也可采取盖草帘子保湿管理，待耳芽长出袋外再掀草帘子即可；采取全光管理时分床宜稍晚，待耳芽绝大多数长出孔外再分床，菌袋间距10cm为宜。
2、浇水管理 分床后浇水与常规管理基本相同，看天看温度浇水，看耳看菌定量。注意问题：前期勤浇、少浇，以保温为主；中期应干湿交替。干，可以干3－4天，以根干为好，湿，要把水浇足，细水勤浇，浇3－4天；中后期气温升高一般在晚上温度降低时浇水，温度高时不能浇水，后期水量不宜过大，防流耳。
3、采摘晾晒 木耳长至3－4公分时要及时采摘晾晒。
